果蝇的深红眼和猩红眼受两对等位基因（A、a和B、b）控制,这两对等位基因位于两对非同源染色体上,它们与眼色素的关系如下图

答案为：（1）、BbXAXa、BbXaY（2）深红眼雌蝇∶猩红眼雌蝇∶深红眼雄蝇∶猩红眼雄蝇∶无色雄蝇=6∶2∶3∶4∶1。分析：由题意实验组①和实验组②知,正交反交的结果不同,则这种性状遗传和性染色体有关,至少有一对染色体是位于性染色体X染色体上的,又因为为题目告诉量规等位基因独立遗传,则这两对等位基因一对位于X染色体上,一对位于常染色体上；还有一点从题以上能够分析出来的,就是含有一种显性基因的时候为猩红色,含有两种显性基因的时候个体为深红色,不含有显性基因的时候个体为无色。我们判断哪一对位于哪一种染色体上,假设A、a位于常染色体上,则B、b位于X染色体上,实验组①的亲本基因型应该为甲aaXBY,乙为AAXbXb,后代基因型及表现型比例为为AaXBXb（深红色雌性）：AaXbY（猩红色雄性）=1:1,与题意中表格内容不符合,假设错误,所以位于常染色体上的是B、b,位于X染色体上的是A、a,两个实验组亲本及其后代的基因型如下：①甲BBXaY 乙bbXAXA,后代的基因型及其表现型比例为为BbXAXa（深红色雌性）：BbXAY（深红色雄性）=1:1；②甲BBXaXa 乙bbXAY,后代的基因型及其表现型比例为为BbXAXa（深红色雌性）：BbXaY（猩红色雄性）=1:11、由以上分析知道实验2的F1中深红眼雌蝇和猩红眼雄蝇的基因型分别BbXAXa、BbXaY2、实验1雌雄之间互交,BbXAXa与BbXAY杂交,计算结果有两种方法,其一,棋盘法,画出16棋盘,很直观的可以看出结果是深红眼雌蝇∶猩红眼雌蝇∶深红眼雄蝇∶猩红眼雄蝇∶无色雄蝇=6∶2∶3∶4∶1；其二,按照自由组合的理念,先计算一对等位基因杂交的结果,再计算另一对等位基因的杂交结果,所得结果相乘,即最后答案。两种思路结果一直,均为深红眼雌蝇∶猩红眼雌蝇∶深红眼雄蝇∶猩红眼雄蝇∶无色雄蝇=6∶2∶3∶4∶1,此处不再啰嗦。