现在已经有了物种全基因组测序,该怎么对该物种每个基因进行分析呢?

这个问题要是能够完美回答就没有那么多国内外生物学家仍在努力奋斗了。事实上,全基因测序得到就如一本“天书”,我们还是像以前那样,比如研究某个基因,任然要做很多实验,各个层次的,分子的蛋白的,研究基因产物的功能结构,和别的蛋白质的关系,受什么影响,细胞定位如何（遗传学和分子生物学）。但是有了基因组测序的方便之处也有很多,比如我们很容易去找到这个基因所在位置,是否有突变,在生信方面可以预测其结构、功能,找同源基因,系统发育树等（生物信息学）,对于低级的模式生物,甚至可以建整个基因组、蛋白组、代谢组的网络（系统生物学）,用于研究高通量数据等等。总之,想回答这个问题,得深入学习我上面提到的学科,并研究下现在的科研文献,才能较为全面的了解。不过看你想知道的深度了。