某承包人与发包人以中标价签订了建设工程施工合同并履行备案手续后，发包人与承包人又签订了要求承包人在中

【正确答案：A】

本题中备案的工程合同和补充协议是属于典型的“黑白”合同，依据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》（以下简称“《解释》”）第21条规定：当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的依据。因此，本题选A。