乙公司将甲承包商订购的材料交由丙公司运送，约定运费由甲支付运输途中遭遇山洪，全部材料被毁关于此损

【正确答案：D】

《合同法》第314条规定：“货物在运输过程中因不可抗力灭失，未收取运费的，承运人不得要求支付运费；已收取运费的，托运人可以要求返还。”山洪暴发属于不可抗力，因而丙不得要求甲支付运费。

《合同法》第144条规定：“出卖人出卖交由承运人运输的在途标的物，除当事人另有约定的以外，毁损、灭失的风险自合同成立时由买受人承担。”因此，材料损失应由甲承担。

故选D。