【正确答案：C】
解法一：因为该企业的纳税地点在市区，所以综合税率为3.48%，应缴纳的税金为100*3.48%=3.48万元。
解法二：含税营业额 =100x(1+3.48%)=103.48万元；
企业应缴纳的营业税=计税营业额 x 3%=103.48x3%=3.1044万元；
企业应缴纳的城市维护建设税=应纳营业税额 x 适用税率=3.1044x 7%=0.2173万元；
企业应缴纳的教育费附加=应纳营业税额 x3%=3.104 x3%=0.0931万元；
企业应缴纳的地方教育附加=应纳营业税额x2%=3.1044x2%=0.0621万元；
所以该企业应缴纳的税金为3.1044+0.2173+0.0931+0.0621=3.48万元，C项正确。
