根据《水利工程建设程序管理暂行规定》（水建[1998] 16号），水利工程质量由（ ）负全面责任

【正确答案：D】

本题考查的是水利工程建设实施阶段的工作内容。水利工程质量由项目法人（建设单位）负全面责任。监理、施工、设计单位按照合同及有关规定对各自承担的工作负责。质量监督机构履行政府部门监督职能，不代替项目法人（建设单位）、监理、设计、施工单位的质量管理工作。水利工程建设各方均有责任和权利向有关部门和质量监督机构反映工程质量问题。故本题的答案为D。