[ 6 ] 新的展望
尽管蛋白酶抑制剂证明了其有效性，但其也有相应的弱点。一方面，蛋白酶抑制剂并非对所有的人有效。另外，由于HIV病毒地进行变异，抗药性也成为一个问题。而且即便确实有疗效，蛋白酶抑制剂又有着严重的副作用。例如，蛋白酶抑制剂可能从很大程度上改变人体代谢储存脂肪的方式。某些艾滋病病人必须服用其它药物用于中和包括恶心、腹泻、肾结石、抑郁以及精神紧张在内的副作用。
制药公司则将研究重点放在解决如何防止病毒产生抗药性上，继续研究开发新一代的安全蛋白酶抑制剂。在研究过程中，研究人员发现现有抑制剂的活性可能会通过以不同的方式结合而得以加强。例如，某些抑制剂可以将药物在肝脏中的新陈代谢速度降低，这也许可以用来延缓其它抑制剂在身体内保留的时间。这样，一种蛋白酶抑制剂便可以帮助减少另一种蛋白酶抑制剂的服用剂量。
在利用蛋白酶抑制剂治疗艾滋病方面的成功——虽然是有限的——却为治疗其它疾病展开了一幅美好的前景。目前，在丙型肝炎病毒、细胞巨化病毒——一种在艾滋病病人中引发致命的器官感染的疱疹型病毒和引发通常感冒的鼻病毒的蛋白酶结构已经被揭示。当科学家们设法解密更多的病毒蛋白酶结构的同时，科学家们也开始认识到在病毒引发疾病之外蛋白酶的重要性。例如，蛋白酶可能与骨质疏松症和感染有关，还可能以非正常的方式杀死脑细胞，从而引发中风或老年痴呆症。
HIV蛋白酶抑制剂真正的成功在于它们对于现代药物研究的革命性影响。HIV抑制剂现在成为了基于病毒结构的药物设计的典范，这其中包括抗艾滋病疫苗的研究。在探寻HIV蛋白酶抑制剂的研究过程中于过去十年间开发出的技术基于对基本的氨基酸和X光结晶学的研究。正由于那些不断探索生物化学的科学家们的努力，那些患上绝症的病人们现在可以重新开始考虑他们的未来了。
