1999年12月14日，巴拿马运河主权交接仪式在巴拿马城附近的米拉弗洛雷斯船闸处举行，巴拿马总统米蕾娅·莫斯科索和美国前总统卡特分别代表两国政府签署了关于运河主权和管辖权交接的换文。至此，这条连接南北美洲大陆、沟通太平洋和大西洋的“黄金水道”名副其实地成了“巴拿马的运河”。
运河回归标志着巴拿马人民为收回运河进行长期英勇斗争的最后胜利，同时也标志着美国在中南美洲大陆殖民统治的终结。
巴拿马是按照1977年9月7日同美国签定的托里霍斯·卡特条约恢复对运河和运河区行使主权和管辖权的。根据该条约，巴拿马于今年12月31日从美国手中正式全面接管巴拿马运河。在此之前，美国全部撤走其在巴拿马运河区的军队。
